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一种结合随机森林和Relief F的全基因组SNP位点分析方法

6602020/06/16
咨询专利 发布专利
基本信息
  • 专利类型 高等院校
  • 委托机构 西安电子科技大学
  • 专利持有方 西安电子科技大学
  • 行业领域 计算机科学与技术
  • 项目名称 一种结合随机森林和Relief F的全基因组SNP位点分析方法
  • 知识产权 发明专利
  • 项目简介 本发明公开了一种结合随机森林和Relief‑F的全基因组SNP位点分析方法，首先应用广义线性模型对SNP位点进行初步筛选，接着利用Relief‑F处理SNP交互作用的能力，预先将存在交互作用的SNP位点排到队列前面，然后将队列后面的SNP位点利用随机森林进行排名，以识别单个SNP位点的边缘作用，这样得到一个SNP的排名队列，去掉排在队列末端的SNP位点之后，重新应用Relief‑F和随机森林进行处理，如此迭代，最后得到SNP位点的排序结果。本发明综合考虑单个SNP位点的作用和位点之间的交互作用，能处理全基因组SNP数据，进而发现与复杂疾病相关的SNP位点，对复杂疾病的致病机理研究、疾病风险预测和生物药物研制等都有重要的意义。
交易信息
  • 意向交易额 面议
  • 挂牌时间 2021/06/16
  • 委托机构 西安电子科技大学
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